Estudios de pérdida de función - Revvity (Horizon)
ARNi VS CRISPR
Para estudios genómicos de pérdida de función Revvity (Horizon) tiene poderosas herramientas para reducir o silenciar efectivamente la expresión genética: CRISPR y ARN de interferencia (ARNi), sin embargo, estos productos son distintos. A continuación, descubre las diferencias entre estas herramientas y cuál sería la mejor para tu investigación.
| ARNi | CRISPR | |
| Tiempo de acción | Transitoria | Permanente |
| Tipo de silenciamiento | Knockdown | Knockout / Konockin |
| Mecanismo celular | Endógeno | Exógeno |
Silenciamiento génico ARNi
Los ARNs de interferencia reducen la expresión génica (knockdown) de forma transitoria.
siARN
Indicados para estudios de pérdida de función rápidos (2-3 días) y garantizados.
siGENOME: altamente potente con una modificación en la cadena sense que le da estabilidad. Es uno de los más referenciados del mercado.
ON-TARGET Plus: muy específico con un patrón de modificación patentado para reducir los efectos off target de doble cadena. Solo la cadena strand entra en RISC.
Accell: para células difíciles de transfectar. No requiere reactivo de transfección o vector viral para su administración. Tiene modificaciones patentadas que aumentan la especificidad, la eficacia de silenciamiento, la captación pasiva y protegen frente a la degradación de la nucleasa.
shARN
Indicados para estudios de pérdida de función transitorios a largo plazo (semanas) e inducibles. Están codificados en un vector que puede introducirse en las células mediante transfección o transducción viral (integrándose en el genoma creando líneas celulares estables).
TRC lentiviral: shARN de horquilla simple diseñado por el RNAi Consortium
GIPZ lentiviral: shARN adaptado a microARN con el reportero GFP.
TRIPZ lentiviral: Expresión inducible y regulable de shARN con el reportero RFP
SMARTvector shARN lentiviral: Silenciamiento génico garantizado con múltiples opciones de promotores y reporteros.
- No inducible
- Inducible: usa la tecnología Tet para un control sin precedentes sobre el silenciamiento génico.
Edición génica CRISPR-Cas9
El sistema CRISPR silencia la expresión génica (knockout/knockin) de forma permanente. Los componentes de los sistemas de edición del genoma CRISPR-Cas9 de Horizon se pueden combinar de múltiples formas para diversas aplicaciones de edición de genes.
El crRNA, tracrRNA y sgRNA se pueden transcribir intracelularmente, transcribir in vitro o sintetizar de forma personalizada e introducir mediante transfección.
La expresión intracelular de Cas9 se puede lograr mediante plásmidos o vectores de expresión lentivirales con promotores constitutivos o inducibles o mediante sistemas sin ADN como el ARNm que codifica Cas9 o las proteínas Cas9.
Para facilitar el trabajo también tienes disponibles células editadas listas para usar y con la posibilidad de personalizarlas.
Para más información consulte esta guía