MALDI-TOF MS

El Control de Calidad (QC) es una parte esencial de cualquier proceso de síntesis de oligonucleótidos. Durante la síntesis, realizamos un monitoreo en línea del tritílo de todos los oligonucleótidos para controlar la eficiencia de acoplamiento en cada ciclo. Todos los oligonucleótidos se analizan y miden rutinariamente mediante medición de densidad óptica (OD 260). Todos los oligonucleótidos modificados y los seleccionados aleatoriamente no modificados se analizan mediante espectrometría de masas MALDI-TOF (Espectrometría de masas por desorción/ionización láser asistida por matriz con análisis de tiempo de vuelo).

De acuerdo con su aplicación, la pureza de su oligonucleótido puede ser verificada mediante un Control de Calidad adicional.

• Análisis por espectrometría de masas MALDI-TOF: Proporciona la información más precisa sobre la longitud, el aducto de desprotección y la verificación de la presencia de etiquetas para oligonucleótidos modificados. Esta es una técnica muy sensible y precisa para oligonucleótidos en un amplio rango de longitudes (hasta 60 bases).
• UHPLC en fase reversa: Proporciona información cuantitativa sobre el nivel de pureza. Esta técnica se utiliza principalmente para oligonucleótidos modificados y es muy eficiente para aquellos de entre 15 y 40 bases de largo.
• UHPLC de intercambio iónico: También puede realizarse para cuantificar el nivel de pureza de los oligonucleótidos. Esta técnica se utiliza principalmente para oligonucleótidos no modificados y es muy eficiente para aquellos de entre 15 y 40 bases de largo.
• Análisis por fluorescencia: Proporciona información cualitativa sobre sus oligonucleótidos fluorescentes.

Si la espectrometría de masas le proporciona información cualitativa precisa sobre la pureza del oligonucleótido, la UHPLC le dará información cuantitativa sobre el nivel de pureza del oligonucleótido sintetizado.